Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC12Q96J65 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCC12Q96J65 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms