Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BORCS6Q96GS4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BORCS6Q96GS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BORCS6Q96GS4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms