Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDXPQ96GD0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDXPQ96GD0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDXPQ96GD0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDXPQ96GD0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDXPQ96GD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms