Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL48Q96GC5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL48Q96GC5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms