Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSPAN17Q96FV3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms