Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms