Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP36Q96EU6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP36Q96EU6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP36Q96EU6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RRP36Q96EU6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RRP36Q96EU6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP36Q96EU6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP36Q96EU6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms