Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms