Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUS1Q96E22 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms