Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RMDN1Q96DB5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms