Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARVELD3Q96A59 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MARVELD3Q96A59 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms