Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN3Q969G5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN3Q969G5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms