Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRG4Q92954 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
PRG4Q92954 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PRG4Q92954 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PRG4Q92954 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms