Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELL1Q92832 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NELL1Q92832 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELL1Q92832 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 919 ms