Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF4BQ92750 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4BQ92750 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF4BQ92750 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms