Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCTD4Q8WVF5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD4Q8WVF5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms