Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF2Q8TEC5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF2Q8TEC5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms