Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDD1Q8TEB9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDD1Q8TEB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms