Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
DDX54Q8TDD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDX54Q8TDD1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
DDX54Q8TDD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms