Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC110Q8TBZ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC110Q8TBZ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms