Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIN3Q8TB24 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN3Q8TB24 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms