Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
APPL2Q8NEU8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL2Q8NEU8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms