Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF548Q8NEK5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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