Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK4Q8NE63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms