Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP2Q8ND30 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP2Q8ND30 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms