Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACBD4Q8NC06 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACBD4Q8NC06 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACBD4Q8NC06 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACBD4Q8NC06 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACBD4Q8NC06 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACBD4Q8NC06 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACBD4Q8NC06 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACBD4Q8NC06 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACBD4Q8NC06 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms