Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC33Q8N5R6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms