Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL2Q8N4E4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms