Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
VPS8Q8N3P4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
VPS8Q8N3P4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
VPS8Q8N3P4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms