Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPICE1Q8N0Z3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPICE1Q8N0Z3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms