Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLGN4XQ8N0W4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4XQ8N0W4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4XQ8N0W4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms