Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC170Q8IYT3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms