Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GATAD2AQ86YP4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATAD2AQ86YP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms