Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VPS37DQ86XT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VPS37DQ86XT2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms