Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZD3Q86UT5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZD3Q86UT5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms