Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM46Q7Z4K8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms