Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP3Q7RTS5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms