Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
KNDC1Q76NI1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms