Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS27LQ71UM5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms