Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP47Q6ZTR5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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