Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY4Q6ZNE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY4Q6ZNE9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms