Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CD109Q6YHK3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CD109Q6YHK3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CD109Q6YHK3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms