Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX2Q6XYB7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX2Q6XYB7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX2Q6XYB7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms