Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMFQ6X4W1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSMFQ6X4W1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms