Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIG3Q6UXM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms