Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms