Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN3Q6P5Z2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN3Q6P5Z2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms