Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE12Q6L8Q7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE12Q6L8Q7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE12Q6L8Q7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms