Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDE2Q6IQ49 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms