Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEG0

SNRNP48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP48Q6IEG0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRNP48Q6IEG0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP48Q6IEG0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRNP48Q6IEG0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms